57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0149 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  100 
 
 		 555 aa  1150    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  47.99 
 
 		 539 aa  515  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  46.01 
 
 		 551 aa  512  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  48.52 
 
 		 535 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  47.51 
 
 		 535 aa  495  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  47.83 
 
 		 524 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  46.09 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  46.35 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  45.54 
 
 		 535 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  45.15 
 
 		 535 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  46.9 
 
 		 538 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  42.73 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  46.71 
 
 		 542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  44.87 
 
 		 564 aa  435  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  43.53 
 
 		 567 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  41.93 
 
 		 541 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  42.1 
 
 		 550 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  42.97 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  44.73 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  42.91 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  43.43 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  42.98 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  42.76 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  43.15 
 
 		 462 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  42.76 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  43.21 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  42.54 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  41.34 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  42.09 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  40.43 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  42.86 
 
 		 467 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  39.38 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  37.76 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  34.74 
 
 		 485 aa  276  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  34.04 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  32.27 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  32.6 
 
 		 576 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  31.47 
 
 		 777 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  30.96 
 
 		 780 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  31.25 
 
 		 777 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  27.27 
 
 		 793 aa  146  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  27.04 
 
 		 630 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  25.37 
 
 		 715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  26.87 
 
 		 605 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  26.29 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  27.22 
 
 		 587 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  25.11 
 
 		 565 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  25.05 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  25.05 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  25.55 
 
 		 604 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  25.15 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  24.29 
 
 		 456 aa  101  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  24.6 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  24.43 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  25.58 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  23.3 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  23.8 
 
 		 461 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>