58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3048 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  97.33 
 
 		 793 aa  1013    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 630 aa  1306    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  87.47 
 
 		 715 aa  909    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  50.2 
 
 		 604 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  49.3 
 
 		 605 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  45.59 
 
 		 565 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  39.22 
 
 		 587 aa  343  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  32.21 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  32.73 
 
 		 461 aa  193  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  32.73 
 
 		 462 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  32.73 
 
 		 462 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  32.5 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  32.73 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  33.18 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  31.85 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  30.65 
 
 		 468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  32.13 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  30 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  32.96 
 
 		 488 aa  183  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  31.52 
 
 		 471 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  30.93 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  29.3 
 
 		 474 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  29.98 
 
 		 464 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  30.13 
 
 		 469 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  30.79 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  30.31 
 
 		 567 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  29.91 
 
 		 524 aa  171  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  28.95 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  31.86 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  29.02 
 
 		 506 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  28.51 
 
 		 576 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  29.1 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  28.73 
 
 		 535 aa  161  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  27.9 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  30.22 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  28.64 
 
 		 535 aa  158  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  28.54 
 
 		 535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  27.9 
 
 		 535 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  28.63 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  27.11 
 
 		 535 aa  150  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  28.16 
 
 		 557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  27.04 
 
 		 555 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  26.85 
 
 		 551 aa  144  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  25.49 
 
 		 539 aa  135  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  26.57 
 
 		 457 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  24.95 
 
 		 456 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  24.24 
 
 		 459 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  24.24 
 
 		 459 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  24.78 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  27.23 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  24.73 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  25.38 
 
 		 463 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  24.35 
 
 		 461 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  25.47 
 
 		 780 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  24.78 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  25.24 
 
 		 777 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  25.24 
 
 		 777 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.45 
 
 		 696 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>