71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2201 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  70.5 
 
 		 459 aa  695    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  67.58 
 
 		 458 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  76.64 
 
 		 457 aa  750    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  100 
 
 		 456 aa  957    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  72.14 
 
 		 461 aa  700    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  70.5 
 
 		 459 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  73.06 
 
 		 463 aa  713    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  72.95 
 
 		 459 aa  687    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  77.83 
 
 		 454 aa  766    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  29.83 
 
 		 469 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  31.33 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  28.4 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  30.67 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  27.58 
 
 		 488 aa  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  29.57 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  28.6 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  29.09 
 
 		 483 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  29.19 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  28.75 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  27.86 
 
 		 485 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  27.45 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  28.23 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  28.02 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  27.82 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  28.94 
 
 		 605 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  26.94 
 
 		 462 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  26.73 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  29.72 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  26.73 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  27.93 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  25.16 
 
 		 715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  28.45 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  27.4 
 
 		 535 aa  130  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  24.95 
 
 		 630 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  24.57 
 
 		 793 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  29.19 
 
 		 550 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  27.52 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  26.04 
 
 		 539 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  27.87 
 
 		 538 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  27.06 
 
 		 524 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 557 aa  119  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  29.08 
 
 		 564 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  25.96 
 
 		 576 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  29.44 
 
 		 542 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  27.51 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  27.85 
 
 		 567 aa  114  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  28.08 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  26.18 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  25.98 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  25.51 
 
 		 506 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  24.29 
 
 		 555 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  26.64 
 
 		 535 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  26.42 
 
 		 587 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  24.82 
 
 		 604 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  25 
 
 		 777 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  26.54 
 
 		 780 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  25 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.54 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  23.65 
 
 		 676 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  25.96 
 
 		 417 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  24.89 
 
 		 623 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  22.66 
 
 		 676 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  27.74 
 
 		 625 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2216  cytochrome c family protein  24.51 
 
 		 623 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000696852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  26.11 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  34.78 
 
 		 709 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  34.78 
 
 		 709 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  34.29 
 
 		 709 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  34.78 
 
 		 709 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  23.77 
 
 		 519 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  34.29 
 
 		 709 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>