58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3142 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  100 
 
 
506 aa  1058    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  53.68 
 
 
539 aa  579  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  51.41 
 
 
551 aa  538  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  52.31 
 
 
542 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  49.2 
 
 
535 aa  506  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  51.7 
 
 
535 aa  504  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  50.2 
 
 
535 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  50.1 
 
 
535 aa  496  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  51.18 
 
 
538 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  50.3 
 
 
535 aa  497  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  49.1 
 
 
524 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  46.09 
 
 
555 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  50.2 
 
 
557 aa  488  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  48.2 
 
 
567 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  47.59 
 
 
564 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  46.31 
 
 
541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  46.06 
 
 
550 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  49.14 
 
 
474 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  47.82 
 
 
474 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  49.89 
 
 
464 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  45.34 
 
 
462 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  45.13 
 
 
468 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  45.12 
 
 
462 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  45.34 
 
 
462 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  45.12 
 
 
462 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  45.34 
 
 
462 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  45.34 
 
 
462 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  44.69 
 
 
461 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  44.49 
 
 
471 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  44.82 
 
 
464 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  44.82 
 
 
467 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  43.04 
 
 
467 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  41.14 
 
 
482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  37.55 
 
 
485 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  37.9 
 
 
488 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  37.47 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  36.01 
 
 
576 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  33.04 
 
 
780 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  32.59 
 
 
777 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  32.59 
 
 
777 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  29.02 
 
 
793 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  29.02 
 
 
630 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  28.48 
 
 
715 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.23 
 
 
587 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  27.79 
 
 
469 aa  143  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  26.33 
 
 
604 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  26.7 
 
 
605 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  24.41 
 
 
565 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  25.16 
 
 
458 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  24.74 
 
 
459 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  24.74 
 
 
459 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  25.51 
 
 
456 aa  103  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  24.48 
 
 
459 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  24.07 
 
 
457 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  24.22 
 
 
454 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  25.65 
 
 
461 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  24.68 
 
 
463 aa  93.6  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0424  cytochrome c family protein  21.79 
 
 
917 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>