57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3284 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  92.86 
 
 		 780 aa  1423    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  100 
 
 		 777 aa  1560    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  98.97 
 
 		 777 aa  1546    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  45.03 
 
 		 576 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  33.73 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  33.73 
 
 		 462 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  33.33 
 
 		 462 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  33.73 
 
 		 462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  33.41 
 
 		 462 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  33.33 
 
 		 474 aa  207  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  34.16 
 
 		 541 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  33.19 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  33.48 
 
 		 462 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  35.28 
 
 		 542 aa  203  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  32.71 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  32.36 
 
 		 464 aa  200  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  34.3 
 
 		 564 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  35.81 
 
 		 474 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  32.02 
 
 		 468 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  30.51 
 
 		 482 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  34.48 
 
 		 464 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  30.7 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  33.12 
 
 		 488 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  31 
 
 		 535 aa  190  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  30.11 
 
 		 535 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  32.13 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  33.85 
 
 		 539 aa  188  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  31.45 
 
 		 567 aa  187  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  32.59 
 
 		 506 aa  187  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  29.51 
 
 		 535 aa  180  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  32.81 
 
 		 550 aa  177  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  30.11 
 
 		 485 aa  177  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  32.96 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  30.11 
 
 		 535 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 483 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  31.04 
 
 		 551 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  31.47 
 
 		 555 aa  172  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  29.44 
 
 		 535 aa  167  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  30.52 
 
 		 467 aa  154  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  29.31 
 
 		 538 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  28.49 
 
 		 605 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  25 
 
 		 793 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  25 
 
 		 630 aa  114  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  32.09 
 
 		 565 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  30.28 
 
 		 587 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  24.71 
 
 		 715 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  24.48 
 
 		 604 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  23.53 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  25 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  25.29 
 
 		 458 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  25 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  26.52 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  25.56 
 
 		 459 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  26.03 
 
 		 459 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  23.38 
 
 		 461 aa  55.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  23.69 
 
 		 463 aa  51.6  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  22.77 
 
 		 457 aa  51.2  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>