59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3005 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  100 
 
 		 567 aa  1193    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  60.8 
 
 		 541 aa  685    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  63.08 
 
 		 550 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  59.92 
 
 		 557 aa  633  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  60.2 
 
 		 542 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  56.97 
 
 		 564 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  51.88 
 
 		 535 aa  520  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  51.39 
 
 		 535 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  50.2 
 
 		 524 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  50.89 
 
 		 535 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  50.39 
 
 		 535 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  48.2 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  49.61 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  44.96 
 
 		 539 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  46.81 
 
 		 551 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  43.53 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  49.02 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  47.96 
 
 		 474 aa  425  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  47.2 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  47.97 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  47.75 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  47.75 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  46.77 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  47.07 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  47.3 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  47.3 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  47.3 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  47.07 
 
 		 462 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  44.8 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  44.15 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  45.15 
 
 		 467 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  39.04 
 
 		 482 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  41.12 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  38.39 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  37.15 
 
 		 483 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  33 
 
 		 576 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  31.09 
 
 		 777 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  31.09 
 
 		 777 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  30.18 
 
 		 780 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  30.31 
 
 		 793 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  30.31 
 
 		 630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  29.02 
 
 		 715 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  31.14 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  31.1 
 
 		 605 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  28.79 
 
 		 565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  28.18 
 
 		 604 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  28.78 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  27.85 
 
 		 456 aa  120  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  27.36 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  26.73 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  26.73 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  26.12 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  26.49 
 
 		 459 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  28.06 
 
 		 461 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  27.43 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  26.49 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.4 
 
 		 884 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.32 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>