61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3130 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  82.23 
 
 		 461 aa  771    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  73.16 
 
 		 459 aa  721    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  76.64 
 
 		 456 aa  750    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  74.12 
 
 		 454 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  75.85 
 
 		 459 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  73.16 
 
 		 459 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  67.43 
 
 		 458 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  79.91 
 
 		 463 aa  783    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  954    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  32.18 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  30.66 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  30.07 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  31.97 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  28.76 
 
 		 483 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  30.18 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  29.22 
 
 		 468 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  27.41 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  26.75 
 
 		 715 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  27.37 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  29.65 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  26.78 
 
 		 793 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  26.57 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  30.89 
 
 		 467 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  28.82 
 
 		 464 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  26.51 
 
 		 485 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  28.15 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  28.21 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  27.23 
 
 		 535 aa  123  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  28.42 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  26.29 
 
 		 605 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  26.38 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  27.23 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  26.91 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  26.38 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  26.38 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  28.48 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  25.16 
 
 		 524 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  26.15 
 
 		 551 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  26.89 
 
 		 539 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  26.58 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  24.07 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  28.99 
 
 		 538 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  25.48 
 
 		 535 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  28.29 
 
 		 542 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  25.27 
 
 		 535 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  26.49 
 
 		 567 aa  97.8  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  26.34 
 
 		 550 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  24.88 
 
 		 604 aa  97.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  25.26 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  24.95 
 
 		 576 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  24.6 
 
 		 555 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  26.22 
 
 		 564 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  26.96 
 
 		 587 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  25.74 
 
 		 535 aa  90.5  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.2 
 
 		 696 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  34.27 
 
 		 780 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  31.97 
 
 		 777 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  22.77 
 
 		 777 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  27.23 
 
 		 625 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  24.47 
 
 		 623 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2216  cytochrome c family protein  24.42 
 
 		 623 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000696852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>