57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2426 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  74.3 
 
 		 535 aa  838    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  73.22 
 
 		 524 aa  828    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  77.94 
 
 		 535 aa  910    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  70.36 
 
 		 535 aa  794    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  100 
 
 		 535 aa  1115    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  70.73 
 
 		 535 aa  788    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  48.02 
 
 		 551 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  51.1 
 
 		 557 aa  508  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  51.39 
 
 		 567 aa  509  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  51.2 
 
 		 541 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  50.2 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  48.52 
 
 		 555 aa  500  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  50.3 
 
 		 550 aa  501  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  50.8 
 
 		 542 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  47.01 
 
 		 539 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  48.01 
 
 		 564 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  50.7 
 
 		 538 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  48.78 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  49 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  48.78 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  47.66 
 
 		 461 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  47.87 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  47.65 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  47.87 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  45.73 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  46.49 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  45.97 
 
 		 464 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  44.9 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  46.7 
 
 		 464 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  44.1 
 
 		 471 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  45.09 
 
 		 467 aa  362  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  41.29 
 
 		 482 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  41.15 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  37.18 
 
 		 485 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  36.84 
 
 		 483 aa  276  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  36.13 
 
 		 488 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  34.62 
 
 		 576 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  30.11 
 
 		 777 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  30.11 
 
 		 777 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  30.32 
 
 		 780 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  28.82 
 
 		 793 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  28.73 
 
 		 630 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  28.82 
 
 		 715 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.8 
 
 		 587 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  26.86 
 
 		 605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  27.49 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  24.47 
 
 		 565 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  26.09 
 
 		 604 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  27.52 
 
 		 456 aa  125  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  26.91 
 
 		 457 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  26.61 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  25.68 
 
 		 459 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  25.68 
 
 		 459 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  27.46 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  25.62 
 
 		 459 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  26.8 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  25.93 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>