59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1588 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  71.7 
 
 		 474 aa  729    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  100 
 
 		 474 aa  989    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  72.61 
 
 		 464 aa  726    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  62.28 
 
 		 467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  49.23 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  47.52 
 
 		 468 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  47.48 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  47.05 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  48.14 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  47.27 
 
 		 462 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  47.27 
 
 		 462 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  46.57 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  47.17 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  46.78 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  49.14 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  51.02 
 
 		 542 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  49.03 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  47.63 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  47.96 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  47.19 
 
 		 550 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  45.25 
 
 		 482 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  47.29 
 
 		 564 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  42.97 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  46.26 
 
 		 535 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  45.02 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  46.34 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  45.73 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  44.76 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  45.81 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  45.59 
 
 		 535 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  40.61 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  44.78 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  41.48 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  43.23 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  40.25 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  43.76 
 
 		 538 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  38.55 
 
 		 576 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 777 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 777 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  32.88 
 
 		 780 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  29.3 
 
 		 630 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  29.14 
 
 		 793 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  30.79 
 
 		 605 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  30.64 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  28.26 
 
 		 715 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  30.66 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  31.33 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  30.63 
 
 		 463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  29.96 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  29.74 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  29.74 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  25.88 
 
 		 565 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  30.02 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  27.65 
 
 		 587 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  30.15 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  31.17 
 
 		 461 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  25.92 
 
 		 604 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1385  hypothetical protein  20.25 
 
 		 490 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.104459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0601  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000425855  normal  0.13133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>