59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0376 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  100 
 
 
539 aa  1127    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  53.68 
 
 
506 aa  579  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  51.23 
 
 
551 aa  527  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  47.99 
 
 
555 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  50.7 
 
 
538 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  49.6 
 
 
542 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  47.09 
 
 
535 aa  485  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  49.6 
 
 
557 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  47.98 
 
 
524 aa  482  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  47.01 
 
 
535 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  47.9 
 
 
564 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  47.06 
 
 
535 aa  457  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  45.21 
 
 
535 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  44.78 
 
 
567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  46.6 
 
 
535 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  45.15 
 
 
550 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  45.19 
 
 
541 aa  422  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  43.23 
 
 
474 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  41.75 
 
 
474 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  40.28 
 
 
468 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  39.96 
 
 
471 aa  351  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  42.67 
 
 
461 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  39.39 
 
 
464 aa  350  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  42.89 
 
 
462 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  42.83 
 
 
462 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  42.51 
 
 
462 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  42.89 
 
 
462 aa  346  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  42.07 
 
 
462 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  42.07 
 
 
462 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  39.91 
 
 
464 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  40.49 
 
 
467 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  38.56 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  39.14 
 
 
467 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  36.04 
 
 
483 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  33.46 
 
 
485 aa  280  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  34.29 
 
 
488 aa  279  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  31.67 
 
 
576 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  33.85 
 
 
777 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  33.85 
 
 
777 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  32.96 
 
 
780 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  28.29 
 
 
587 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  27.33 
 
 
565 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  25.49 
 
 
630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  25.49 
 
 
793 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  25.68 
 
 
715 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  26.04 
 
 
456 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  26.23 
 
 
459 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  25.87 
 
 
459 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  25.85 
 
 
469 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  28.08 
 
 
459 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  25.43 
 
 
605 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  25.98 
 
 
463 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  25.96 
 
 
458 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  26.52 
 
 
454 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  28.31 
 
 
461 aa  107  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  26.89 
 
 
457 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  24.32 
 
 
604 aa  98.2  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1172  cytochrome c family protein  21.41 
 
 
320 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00131961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.95 
 
 
696 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>