57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2147 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  100 
 
 		 467 aa  976    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  59.49 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  60.73 
 
 		 464 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  58.65 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  46.93 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  46.68 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  44.33 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  46.47 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  45.4 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  46.47 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  46.25 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  45.4 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  45.18 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  45.95 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  46.36 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  43.85 
 
 		 542 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  42.35 
 
 		 541 aa  361  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  43.04 
 
 		 506 aa  359  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  40.12 
 
 		 482 aa  358  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  41.21 
 
 		 524 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  41.69 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  41.58 
 
 		 535 aa  334  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  41.78 
 
 		 550 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  41.14 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  39.83 
 
 		 567 aa  330  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  41.15 
 
 		 535 aa  329  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  40.93 
 
 		 564 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  39.17 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  38.83 
 
 		 555 aa  323  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  40.63 
 
 		 557 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  39 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  39.32 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  40.64 
 
 		 535 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  37.55 
 
 		 539 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  40.22 
 
 		 538 aa  296  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  35.32 
 
 		 576 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  28.73 
 
 		 793 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  29.1 
 
 		 630 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  31.51 
 
 		 605 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  30.14 
 
 		 777 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  30.14 
 
 		 777 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  30.82 
 
 		 780 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  28.14 
 
 		 715 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  29.86 
 
 		 456 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  25.39 
 
 		 565 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.19 
 
 		 587 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  27.25 
 
 		 469 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  30.89 
 
 		 457 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  28.75 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  29.45 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  28.28 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  27.25 
 
 		 604 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  28.88 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  28.54 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  27.76 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>