57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3090 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  100 
 
 
780 aa  1572    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  92.86 
 
 
777 aa  1439    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  93.25 
 
 
777 aa  1447    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  45.24 
 
 
576 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  35.02 
 
 
461 aa  218  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  33.53 
 
 
462 aa  214  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  33.53 
 
 
462 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  34.36 
 
 
462 aa  213  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  33.19 
 
 
462 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  32.88 
 
 
474 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  32.97 
 
 
462 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  33.26 
 
 
462 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  32.36 
 
 
464 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  32.5 
 
 
471 aa  201  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  33.26 
 
 
541 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  33.86 
 
 
542 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  31.61 
 
 
468 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  32.89 
 
 
564 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  30.79 
 
 
482 aa  195  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  30.7 
 
 
524 aa  194  8e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  34.02 
 
 
464 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  32.83 
 
 
488 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  34.68 
 
 
474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  33.04 
 
 
506 aa  191  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  30.47 
 
 
535 aa  190  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  32.13 
 
 
467 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  30.32 
 
 
535 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  32.96 
 
 
539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  30.18 
 
 
567 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  30.5 
 
 
485 aa  181  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  28.67 
 
 
535 aa  178  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  31.46 
 
 
551 aa  177  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  29.89 
 
 
535 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  32.29 
 
 
550 aa  175  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  31.53 
 
 
557 aa  171  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  30.96 
 
 
555 aa  171  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  29.82 
 
 
483 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  29.21 
 
 
535 aa  167  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  31.21 
 
 
467 aa  151  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  28.6 
 
 
538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  28.39 
 
 
605 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  25.24 
 
 
793 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  25.24 
 
 
630 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  24.94 
 
 
715 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  24.59 
 
 
604 aa  111  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  26.23 
 
 
587 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  31.08 
 
 
565 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  24.89 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  26.54 
 
 
456 aa  64.7  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  27.7 
 
 
458 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  26.52 
 
 
459 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  24.92 
 
 
454 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  26.49 
 
 
459 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  25.99 
 
 
459 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  34.27 
 
 
457 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  28.64 
 
 
461 aa  51.6  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  28.99 
 
 
463 aa  51.6  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>