57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0458 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  90.48 
 
 		 462 aa  902    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  80.09 
 
 		 467 aa  759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  98.27 
 
 		 462 aa  958    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  100 
 
 		 462 aa  970    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  78.26 
 
 		 468 aa  791    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  76.09 
 
 		 471 aa  766    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  80.14 
 
 		 464 aa  768    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  90.04 
 
 		 462 aa  898    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  98.48 
 
 		 462 aa  959    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  90.02 
 
 		 461 aa  895    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  90.26 
 
 		 462 aa  899    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  52.94 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  50.64 
 
 		 474 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  47.05 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  48.42 
 
 		 541 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  46.03 
 
 		 482 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  45.95 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  47.65 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  46.95 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  47.87 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  46 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  46.44 
 
 		 535 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  45.12 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  46.19 
 
 		 535 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  47.07 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  44.14 
 
 		 550 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  47.2 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  46.55 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  43.21 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  46.24 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  44.94 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  43.07 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  43.44 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  42.11 
 
 		 551 aa  351  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  42.51 
 
 		 539 aa  347  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  43.07 
 
 		 538 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  36.02 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  33.48 
 
 		 777 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  33.48 
 
 		 777 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 780 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  31.52 
 
 		 793 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  31.85 
 
 		 630 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  31.15 
 
 		 715 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.59 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  28.44 
 
 		 565 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  30.16 
 
 		 605 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  28.85 
 
 		 469 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  29.01 
 
 		 604 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  28.23 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  29.08 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 454 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  28.83 
 
 		 463 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  28.39 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  28.03 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  27.83 
 
 		 459 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  29.4 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  28.42 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>