60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1764 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  77.87 
 
 		 483 aa  772    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  100 
 
 		 488 aa  1017    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  66.88 
 
 		 485 aa  691    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  57.95 
 
 		 482 aa  588  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  44.1 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  41.48 
 
 		 474 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  43.4 
 
 		 462 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  43.37 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  43.07 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  44.08 
 
 		 464 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  43.19 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  43.07 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  43.07 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  42.86 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  44.31 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  42.65 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  44.13 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  41.53 
 
 		 467 aa  342  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  39.83 
 
 		 542 aa  307  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  39.11 
 
 		 467 aa  299  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  36.86 
 
 		 551 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  39.35 
 
 		 564 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  37.9 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  36.99 
 
 		 524 aa  293  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 567 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 539 aa  280  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  36.42 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  36.7 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  36.85 
 
 		 535 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  36.64 
 
 		 535 aa  274  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  34.04 
 
 		 555 aa  273  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  37.8 
 
 		 538 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  36.56 
 
 		 535 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  36.56 
 
 		 535 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  37.34 
 
 		 550 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  32.56 
 
 		 576 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  33.12 
 
 		 777 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  32.83 
 
 		 780 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  32.9 
 
 		 777 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  32.96 
 
 		 793 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  32.96 
 
 		 630 aa  183  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  31.74 
 
 		 715 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  32.8 
 
 		 605 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.39 
 
 		 587 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  27.58 
 
 		 456 aa  153  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  27.83 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  31 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  28.7 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  27.36 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  28.27 
 
 		 459 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  28.57 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  27.37 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  28.27 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  28.01 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  28.17 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  26.17 
 
 		 604 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  26.47 
 
 		 620 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  25.29 
 
 		 626 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  29.59 
 
 		 563 aa  43.5  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>