23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4027 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  63.3 
 
 		 657 aa  814    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  95.63 
 
 		 618 aa  1215    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  64.94 
 
 		 631 aa  799    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  100 
 
 		 626 aa  1306    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  60 
 
 		 620 aa  771    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  77.2 
 
 		 620 aa  987    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  28.53 
 
 		 620 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  24.83 
 
 		 790 aa  183  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  25.82 
 
 		 709 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  22.14 
 
 		 949 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  24.29 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  25.41 
 
 		 1432 aa  53.9  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  24.32 
 
 		 418 aa  53.9  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  23.78 
 
 		 418 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  25.32 
 
 		 1532 aa  51.2  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  24.67 
 
 		 414 aa  51.2  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1344 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.27 
 
 		 806 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  23.46 
 
 		 454 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  27.82 
 
 		 417 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  33.77 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  25.29 
 
 		 488 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3137  cytochrome c family protein  23.27 
 
 		 591 aa  44.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>