13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0601 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0601  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000425855  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1197  hypothetical protein  37.5 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  35.37 
 
 		 1916 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  29.45 
 
 		 1848 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  25.69 
 
 		 1196 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  27.31 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  46.67 
 
 		 884 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2808  cytochrome c family protein  43.55 
 
 		 189 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000226609  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  25.9 
 
 		 867 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  36.11 
 
 		 712 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1284 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  24.89 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  22.82 
 
 		 217 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>