220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1427 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  100 
 
 
696 aa  1441    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2425  formate dehydrogenase gamma subunit  34.25 
 
 
369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  25.14 
 
 
848 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  26.85 
 
 
1017 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5489  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.15 
 
 
341 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  35.82 
 
 
204 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  35.32 
 
 
204 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  32.08 
 
 
339 aa  110  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1118  formate dehydrogenase, cytochrome B556 subunit  30.77 
 
 
357 aa  109  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0506  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.51 
 
 
342 aa  106  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.579311 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003492  formate dehydrogenase -O gamma subunit  29.57 
 
 
350 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02280  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  29.53 
 
 
350 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1455  putative formate dehydrogenase  30.04 
 
 
339 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3372  formate dehydrogenase, gamma subunit  35.89 
 
 
210 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0870  formate dehydrogenase gamma subunit  31.34 
 
 
222 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2138  formate dehydrogenase, cytochrome B subunit  29.66 
 
 
315 aa  100  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.739524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1289  formate dehydrogenase gamma subunit  32.24 
 
 
370 aa  99  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60343  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3725  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.34 
 
 
384 aa  98.6  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.455366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2010  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.37 
 
 
239 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4059  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.65 
 
 
408 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3205  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.24 
 
 
345 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5280  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.43 
 
 
339 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0685  formate dehydrogenase gamma subunit  30.87 
 
 
398 aa  94.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368293  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1917  formate dehydrogenase gamma subunit  30.52 
 
 
347 aa  94.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0391  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.98 
 
 
345 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0423  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.98 
 
 
345 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0459  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.55 
 
 
345 aa  94  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1173  formate dehydrogenase gamma subunit  29.05 
 
 
388 aa  94  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601281  normal  0.202143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2788  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.18 
 
 
401 aa  93.2  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0675337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3089  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.05 
 
 
339 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971342  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3461  formate dehydrogenase gamma subunit  28.48 
 
 
401 aa  94  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.293351 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0709  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.82 
 
 
208 aa  92.8  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  28.08 
 
 
218 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1778  formate dehydrogenase, cytochrome B subunit  27.62 
 
 
314 aa  91.3  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000176225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2370  hypothetical protein  30.59 
 
 
384 aa  90.9  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4371  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.21 
 
 
211 aa  90.9  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4278  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.21 
 
 
211 aa  90.9  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0059  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.94 
 
 
338 aa  90.9  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.59 
 
 
218 aa  90.5  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.59 
 
 
218 aa  90.5  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  29.21 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.41 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.21 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.21 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.41 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  29.21 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.94 
 
 
218 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.41 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.21 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  27.94 
 
 
218 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.41 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.21 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.41 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.21 
 
 
211 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.412643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3258  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.44 
 
 
396 aa  89.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.263075  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1501  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  29.57 
 
 
310 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3706  formate dehydrogenase, gamma subunit  33.17 
 
 
340 aa  89.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1429  formate dehydrogenase-O subunit gamma  31.47 
 
 
211 aa  88.2  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2179  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.72 
 
 
387 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364942  normal  0.0604921 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1861  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  29.57 
 
 
310 aa  88.6  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0355  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  29.29 
 
 
309 aa  88.2  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0335  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.63 
 
 
342 aa  87.8  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2583  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.85 
 
 
387 aa  87  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2758  formate dehydrogenase subunit gamma  28.74 
 
 
397 aa  87.4  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2072  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.38 
 
 
299 aa  87  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1682  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  29.96 
 
 
310 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2700  formate dehydrogenase gamma subunit  28.72 
 
 
217 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604172  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3722  formate dehydrogenase gamma subunit  27.39 
 
 
342 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.973901  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3793  formate dehydrogenase gamma subunit  27.39 
 
 
342 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3918  formate dehydrogenase gamma subunit  27.39 
 
 
342 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0837  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.17 
 
 
390 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.16 
 
 
211 aa  86.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4511  formate dehydrogenase, C subunit, putative  27.39 
 
 
342 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1395  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.77 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.798928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  27.86 
 
 
211 aa  86.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3896  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.86 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3812  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.86 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1483  formate dehydrogenase, cytochrome B subunit  26.67 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.88 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0573  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.88 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15666  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1780  formate dehydrogenase, cytochrome B subunit  27.59 
 
 
310 aa  84  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.88 
 
 
208 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4520  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.85 
 
 
211 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.88 
 
 
208 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.88 
 
 
208 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.88 
 
 
208 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  29.32 
 
 
213 aa  83.2  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0808  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.48 
 
 
299 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0546  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.21 
 
 
218 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0061  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.13 
 
 
335 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0452  formate dehydrogenase gamma subunit  31.84 
 
 
226 aa  82  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.88 
 
 
208 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0231  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.56 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4138  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.56 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4226  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.56 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4108  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.56 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0040  formate dehydrogenase-O subunit gamma  30.46 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3768  formate dehydrogenase-O subunit gamma  30.46 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4117  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.8 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0940  formate dehydrogenase gamma subunit  29.8 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>