19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2006 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2216  cytochrome c family protein  95.4 
 
 		 623 aa  1226    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000696852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  71.33 
 
 		 625 aa  936    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  100 
 
 		 623 aa  1302    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0170  cytochrome c family protein  36.45 
 
 		 596 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3137  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 591 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  27.14 
 
 		 418 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  27.55 
 
 		 418 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  25.33 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  24.59 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  24.18 
 
 		 459 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  24.18 
 
 		 459 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  28.43 
 
 		 417 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  24.6 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  24.57 
 
 		 456 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  26.42 
 
 		 461 aa  47.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  26.83 
 
 		 463 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  24.47 
 
 		 457 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  25.53 
 
 		 414 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  29.56 
 
 		 356 aa  43.9  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>