33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4456 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  77.79 
 
 		 678 aa  1092    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  51.88 
 
 		 690 aa  755    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  54.25 
 
 		 645 aa  694    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  50.08 
 
 		 652 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  50.08 
 
 		 650 aa  646    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  78.35 
 
 		 678 aa  1108    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  100 
 
 		 676 aa  1430    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  71.7 
 
 		 687 aa  1030    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  95.41 
 
 		 676 aa  1323    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  78.38 
 
 		 678 aa  1111    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  89.2 
 
 		 676 aa  1254    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  51.52 
 
 		 688 aa  706    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  51.56 
 
 		 664 aa  717    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  69.3 
 
 		 709 aa  1010    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  68.35 
 
 		 709 aa  999    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  50.24 
 
 		 656 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  69.58 
 
 		 709 aa  1018    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  69.72 
 
 		 709 aa  1021    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  69.3 
 
 		 709 aa  1014    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  55.25 
 
 		 656 aa  724    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  87.59 
 
 		 679 aa  1249    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  67.65 
 
 		 709 aa  991    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.02 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  24.44 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 799 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  20.96 
 
 		 539 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  23.65 
 
 		 456 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  23.65 
 
 		 458 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.8 
 
 		 784 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  38.98 
 
 		 516 aa  45.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  22.27 
 
 		 536 aa  44.3  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  27.1 
 
 		 280 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  23.15 
 
 		 454 aa  44.3  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>