36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3159 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  97.4 
 
 
656 aa  1277    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  54.74 
 
 
645 aa  722    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  100 
 
 
652 aa  1367    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  97.7 
 
 
650 aa  1288    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  48.7 
 
 
678 aa  656    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  49.14 
 
 
676 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  51.37 
 
 
687 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  48.7 
 
 
678 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  50.72 
 
 
676 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  49.77 
 
 
678 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  53.46 
 
 
664 aa  728    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  49.92 
 
 
709 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  50.79 
 
 
709 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  50.08 
 
 
709 aa  646    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  50.08 
 
 
709 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  49.92 
 
 
709 aa  648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  56.99 
 
 
656 aa  767    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  51.1 
 
 
709 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  51.37 
 
 
679 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  49.92 
 
 
676 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  50.16 
 
 
690 aa  630  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  48.9 
 
 
688 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.98 
 
 
556 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  24.43 
 
 
425 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  22.87 
 
 
563 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  27.54 
 
 
408 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  25.54 
 
 
356 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
537 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  29.63 
 
 
259 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  21.66 
 
 
539 aa  47.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  22.17 
 
 
516 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  28.32 
 
 
312 aa  44.3  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
654 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1198  hypothetical protein  26.32 
 
 
418 aa  44.3  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.43 
 
 
799 aa  44.3  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0955  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  21.99 
 
 
489 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>