25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1504 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  751    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  24.62 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  27.98 
 
 		 625 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  27.04 
 
 		 650 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  27.04 
 
 		 656 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  27.04 
 
 		 652 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  20.77 
 
 		 620 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  22.3 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  22.15 
 
 		 418 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  40.32 
 
 		 1344 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  24.71 
 
 		 656 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  29.79 
 
 		 790 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  19.03 
 
 		 620 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2432  cytochrome c552  23.86 
 
 		 477 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  47.62 
 
 		 620 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  20.82 
 
 		 657 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  23.9 
 
 		 640 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  29.56 
 
 		 623 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  26.42 
 
 		 618 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  40.91 
 
 		 1432 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  38.18 
 
 		 1532 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  42.86 
 
 		 626 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  34.59 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2216  cytochrome c family protein  28.93 
 
 		 623 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000696852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2735  cytochrome c552  30.99 
 
 		 472 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>