38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0063 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  55.09 
 
 
679 aa  709    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  52.66 
 
 
678 aa  699    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  54.77 
 
 
676 aa  711    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  56.12 
 
 
687 aa  733    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  54.12 
 
 
676 aa  698    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  54.85 
 
 
678 aa  700    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  54.44 
 
 
676 aa  709    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  63.39 
 
 
664 aa  913    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  56.47 
 
 
709 aa  729    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  52.66 
 
 
678 aa  704    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  53.63 
 
 
709 aa  738    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  100 
 
 
656 aa  1384    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  59.25 
 
 
650 aa  760    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  56.31 
 
 
709 aa  729    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  56.31 
 
 
709 aa  729    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  56.47 
 
 
709 aa  728    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  59.08 
 
 
652 aa  759    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  80.65 
 
 
645 aa  1065    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  59.08 
 
 
656 aa  759    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  56.78 
 
 
709 aa  738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  49.14 
 
 
690 aa  620  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  45.96 
 
 
688 aa  594  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  24.54 
 
 
563 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  23.74 
 
 
536 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  21.18 
 
 
425 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  25.61 
 
 
556 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  27.75 
 
 
469 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  26.71 
 
 
391 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  23.91 
 
 
394 aa  50.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.61 
 
 
651 aa  47.8  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  25.29 
 
 
516 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  24.71 
 
 
356 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.17 
 
 
784 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  30.2 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  20.74 
 
 
539 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  23.77 
 
 
755 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  27.96 
 
 
577 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  28.78 
 
 
259 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>