25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0223 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  59.99 
 
 		 1532 aa  1777    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  63.66 
 
 		 1432 aa  1797    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  100 
 
 		 1344 aa  2809    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  25.56 
 
 		 790 aa  78.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  22.36 
 
 		 949 aa  76.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  30.77 
 
 		 2096 aa  75.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  24.15 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  23.26 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  20.71 
 
 		 631 aa  57  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  32.95 
 
 		 4231 aa  55.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  26.23 
 
 		 882 aa  55.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  22.81 
 
 		 657 aa  55.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.06 
 
 		 14944 aa  55.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  25.17 
 
 		 709 aa  50.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  22.99 
 
 		 618 aa  50.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0043  LVIVD repeat-containing protein  24.28 
 
 		 796 aa  49.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  22.99 
 
 		 626 aa  49.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  36.36 
 
 		 14609 aa  48.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  37.25 
 
 		 620 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14688  predicted protein  37.01 
 
 		 694 aa  47.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.228667  normal  0.32503 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  40.32 
 
 		 356 aa  47.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1948  hypothetical protein  27.45 
 
 		 713 aa  47  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.97 
 
 		 11716 aa  46.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.11 
 
 		 5216 aa  45.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 		 658 aa  45.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>