16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1948 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1436    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.71 
 
 		 2096 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  31.02 
 
 		 4231 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0043  LVIVD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 796 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 		 658 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  27.5 
 
 		 645 aa  74.7  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  25.51 
 
 		 14944 aa  71.2  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0387  LVIVD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1232  LVIVD repeat protein  25.19 
 
 		 717 aa  61.2  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.21 
 
 		 12684 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1611  LVIVD repeat-containing protein  22.95 
 
 		 568 aa  55.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.9 
 
 		 5216 aa  51.6  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.71 
 
 		 11716 aa  50.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  33.7 
 
 		 14609 aa  48.5  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1344 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  25.57 
 
 		 472 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>