13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0043 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0043  LVIVD repeat-containing protein  100 
 
 		 796 aa  1594    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1948  hypothetical protein  24.51 
 
 		 713 aa  84.7  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.56 
 
 		 2096 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.05 
 
 		 4231 aa  58.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 645 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  32.88 
 
 		 882 aa  54.3  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1344 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.69 
 
 		 658 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  38.83 
 
 		 12684 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  25.86 
 
 		 1432 aa  47.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.88 
 
 		 14944 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.18 
 
 		 5216 aa  47.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  34.31 
 
 		 1532 aa  45.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>