20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1199 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  56.82 
 
 		 657 aa  740    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  59.09 
 
 		 618 aa  754    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  58.93 
 
 		 631 aa  727    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  60.44 
 
 		 626 aa  768    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1296    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  59.56 
 
 		 620 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  27.9 
 
 		 620 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  24.65 
 
 		 790 aa  193  6e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  25.86 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  23.13 
 
 		 949 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  23.84 
 
 		 1432 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  25.36 
 
 		 412 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  26.32 
 
 		 418 aa  50.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  24.81 
 
 		 418 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  28.87 
 
 		 417 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  37.25 
 
 		 1344 aa  47.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  41.67 
 
 		 1532 aa  47.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3137  cytochrome c family protein  23.83 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  19.03 
 
 		 356 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  26.43 
 
 		 414 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>