38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2521 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1330    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 781 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  26.81 
 
 		 651 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 		 784 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 742 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 743 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  28.35 
 
 		 773 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 828 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  27.45 
 
 		 817 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.42 
 
 		 799 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 764 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  25.73 
 
 		 758 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 764 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  25.64 
 
 		 708 aa  114  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 687 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  22.5 
 
 		 778 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  26.73 
 
 		 755 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  24.38 
 
 		 649 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 729 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 771 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  25.75 
 
 		 767 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 802 aa  97.8  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  24.67 
 
 		 390 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  23.95 
 
 		 394 aa  90.1  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  21.76 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 654 aa  82  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  22.49 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  23.12 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  23.18 
 
 		 595 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  21.34 
 
 		 386 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  24.03 
 
 		 697 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  21.9 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  26.7 
 
 		 383 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  25.97 
 
 		 519 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  30.63 
 
 		 536 aa  44.3  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  23.9 
 
 		 356 aa  44.3  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>