38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0488 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  93.35 
 
 		 709 aa  1384    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  50 
 
 		 690 aa  719    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  54.86 
 
 		 645 aa  717    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  50.08 
 
 		 652 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  50.08 
 
 		 650 aa  654    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  67.98 
 
 		 678 aa  984    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  69.58 
 
 		 676 aa  1008    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  85.9 
 
 		 687 aa  1258    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  69.58 
 
 		 676 aa  1009    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  68.68 
 
 		 678 aa  990    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  69.58 
 
 		 676 aa  1007    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  68.45 
 
 		 678 aa  991    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  51.69 
 
 		 688 aa  692    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  54 
 
 		 664 aa  712    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  98.45 
 
 		 709 aa  1478    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  50.55 
 
 		 656 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  100 
 
 		 709 aa  1495    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  99.44 
 
 		 709 aa  1488    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  56.47 
 
 		 656 aa  743    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  96.76 
 
 		 709 aa  1425    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  70.14 
 
 		 679 aa  1023    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  90.69 
 
 		 709 aa  1342    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  25.51 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.09 
 
 		 556 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  21.4 
 
 		 539 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  23.11 
 
 		 394 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  20 
 
 		 799 aa  48.5  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  26.64 
 
 		 286 aa  48.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 537 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  23.18 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  22.34 
 
 		 755 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.25 
 
 		 651 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  24.56 
 
 		 708 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  26.35 
 
 		 456 aa  44.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.82 
 
 		 784 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  21.88 
 
 		 425 aa  44.3  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  25.37 
 
 		 287 aa  44.3  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  34.85 
 
 		 469 aa  44.3  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>