68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1942 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  892    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  28.42 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  28.3 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  27.75 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  30.45 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  27.11 
 
 		 817 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 		 773 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 828 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  25.23 
 
 		 758 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 781 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  22.12 
 
 		 595 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  29.18 
 
 		 563 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 		 784 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  24.94 
 
 		 651 aa  94  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  26.11 
 
 		 697 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 654 aa  93.2  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  25.66 
 
 		 649 aa  90.9  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 764 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  23.53 
 
 		 778 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  21.76 
 
 		 640 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  26.13 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  22.97 
 
 		 743 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  25.25 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 771 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.83 
 
 		 799 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  25.14 
 
 		 708 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  23.72 
 
 		 742 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 687 aa  70.5  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  22.58 
 
 		 755 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 802 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 729 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  24.41 
 
 		 353 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  25.07 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  24.18 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  23.77 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  21.18 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  23.72 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  24.89 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  24.35 
 
 		 767 aa  57.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  24.43 
 
 		 652 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  24.43 
 
 		 650 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  24.65 
 
 		 664 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  21.1 
 
 		 469 aa  53.5  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  22.99 
 
 		 516 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  21.05 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  26.29 
 
 		 645 aa  49.3  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  23.86 
 
 		 539 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2735  cytochrome c552  28.07 
 
 		 472 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  28.48 
 
 		 259 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0685  cytochrome c552  23.21 
 
 		 467 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000162376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  25.2 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2432  cytochrome c552  25.33 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  21.41 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  24.58 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  21.57 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4234  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.13 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3631  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  26.35 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000140973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  26.6 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3036  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  21.65 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.306753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  25.44 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0658  cytochrome c552  24.71 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.034848  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0030  hypothetical protein  22.55 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  29.85 
 
 		 833 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0844  cytochrome c552  25 
 
 		 466 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000415815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  36.76 
 
 		 709 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  24.14 
 
 		 690 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>