26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0993 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  100 
 
 		 595 aa  1240    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  22.12 
 
 		 425 aa  97.8  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  26.44 
 
 		 697 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  28.05 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  29.18 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  25.12 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 771 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.19 
 
 		 784 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 764 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  22.08 
 
 		 453 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  21.67 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 		 799 aa  54.3  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  30.1 
 
 		 649 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 828 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  34.44 
 
 		 758 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  21.72 
 
 		 778 aa  50.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  30.58 
 
 		 773 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  21.69 
 
 		 755 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  24.34 
 
 		 519 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  21.47 
 
 		 651 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  28.69 
 
 		 817 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  38.1 
 
 		 708 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  20.22 
 
 		 729 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  40.74 
 
 		 742 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 		 781 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  25.88 
 
 		 259 aa  43.5  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>