44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3262 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  959    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  28.42 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  24.07 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  23.7 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  24.43 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  24.16 
 
 		 708 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  24.41 
 
 		 758 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  22.44 
 
 		 743 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  22.87 
 
 		 778 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  23.12 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  21.51 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  23.22 
 
 		 817 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  33.58 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 802 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  22.08 
 
 		 595 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  21.69 
 
 		 773 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  37.1 
 
 		 784 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.37 
 
 		 799 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 781 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  21.22 
 
 		 651 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.94 
 
 		 556 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  21.53 
 
 		 654 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  22.4 
 
 		 649 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  22.6 
 
 		 519 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  22.28 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 729 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  20.68 
 
 		 516 aa  50.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  25.13 
 
 		 353 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  20.63 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  22.68 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  22.32 
 
 		 755 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  22.71 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  32.81 
 
 		 658 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  20.67 
 
 		 771 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  21.36 
 
 		 539 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  26.5 
 
 		 658 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  24.1 
 
 		 656 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  26.19 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  21.95 
 
 		 540 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>