More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0379 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  100 
 
 		 767 aa  1598    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 771 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  29.89 
 
 		 817 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 764 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  30.42 
 
 		 742 aa  259  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 764 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  29.37 
 
 		 758 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  27.51 
 
 		 743 aa  259  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.55 
 
 		 784 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 828 aa  258  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  29.62 
 
 		 773 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 781 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 687 aa  251  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 802 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  27.2 
 
 		 651 aa  245  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  28.59 
 
 		 778 aa  243  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  29.39 
 
 		 755 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  31.05 
 
 		 649 aa  234  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  28 
 
 		 708 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.82 
 
 		 799 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 729 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  25.75 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 878 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.01 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.57 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 374 aa  70.1  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.24 
 
 		 836 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.75 
 
 		 810 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.62 
 
 		 725 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 634 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  33.58 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 955 aa  64.7  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 935 aa  64.7  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 448 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 243 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  29.12 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 4079 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1276 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 		 589 aa  61.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1297 aa  61.2  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 3560 aa  61.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.58 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  31.4 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.22 
 
 		 795 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 		 632 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 233 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.46 
 
 		 820 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.74 
 
 		 760 aa  58.9  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  20.18 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.64 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 886 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 708 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  24.35 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 747 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  23.89 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.16 
 
 		 1979 aa  57.4  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 761 aa  57  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.42 
 
 		 988 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1049 aa  57.4  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 366 aa  56.6  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1138 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 		 274 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 465 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 		 1737 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.36 
 
 		 626 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 620 aa  56.2  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  29.65 
 
 		 395 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.04 
 
 		 373 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  22.66 
 
 		 391 aa  55.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 274 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 274 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 762 aa  55.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 685 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1094 aa  55.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 1450 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  35 
 
 		 550 aa  54.7  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1192 aa  54.3  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 257 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.28 
 
 		 626 aa  54.3  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 		 406 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 		 406 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  23.68 
 
 		 695 aa  53.9  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.49 
 
 		 462 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 652 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 614 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  23.08 
 
 		 545 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 245 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 566 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 468 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  30.6 
 
 		 612 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.67 
 
 		 745 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 614 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>