290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6906 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  65.05 
 
 		 764 aa  977    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  100 
 
 		 758 aa  1565    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  64.55 
 
 		 802 aa  934    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  38.93 
 
 		 781 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 828 aa  485  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  36.06 
 
 		 784 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 771 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 		 764 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  34.05 
 
 		 743 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  34.84 
 
 		 817 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  36.24 
 
 		 773 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  36.24 
 
 		 742 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  35.72 
 
 		 729 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  39.37 
 
 		 687 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  34.18 
 
 		 651 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  34.98 
 
 		 649 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 778 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  31.3 
 
 		 708 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  35.39 
 
 		 755 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 		 799 aa  346  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  29.96 
 
 		 767 aa  275  3e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  24.78 
 
 		 640 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  25.06 
 
 		 425 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  19.59 
 
 		 654 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  23.1 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  24.41 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  23.41 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  25.21 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 399 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  23.7 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 1737 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 351 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  27.82 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  24.26 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.08 
 
 		 810 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 632 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 878 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 685 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.29 
 
 		 725 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  26.2 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  23.76 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 465 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  26.37 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.17 
 
 		 795 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.75 
 
 		 620 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 847 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.14 
 
 		 462 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 776 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 562 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 472 aa  55.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 486 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.16 
 
 		 1154 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 750 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 274 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1406 aa  54.3  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 		 566 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.45 
 
 		 1979 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.06 
 
 		 340 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 505 aa  53.9  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 559 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  21.03 
 
 		 563 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 512 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 808 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 740 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 362 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 715 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.77 
 
 		 395 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.47 
 
 		 707 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 542 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 649 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  24.51 
 
 		 595 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 649 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  32.5 
 
 		 700 aa  52.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1121 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 556 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 248 aa  52.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 824 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  33.88 
 
 		 725 aa  52.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 739 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1276 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.03 
 
 		 732 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 374 aa  52  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 362 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.56 
 
 		 875 aa  52  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 2262 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.23 
 
 		 887 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.39 
 
 		 1022 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 615 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.6 
 
 		 265 aa  51.6  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 646 aa  52  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 968 aa  51.6  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1450 aa  51.6  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 649 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  34.44 
 
 		 595 aa  51.6  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  28.47 
 
 		 535 aa  51.2  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 573 aa  51.2  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>