86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3872 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  100 
 
 
742 aa  1511    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  45.07 
 
 
828 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  44.46 
 
 
784 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  43.69 
 
 
817 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  42.57 
 
 
773 aa  552  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  43.6 
 
 
781 aa  548  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  38.58 
 
 
743 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  42.07 
 
 
764 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 
771 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  38.77 
 
 
708 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  34.9 
 
 
778 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  36.24 
 
 
758 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  36.93 
 
 
764 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  32.65 
 
 
799 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  37.75 
 
 
755 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  39.27 
 
 
649 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 
802 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
729 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  41.78 
 
 
687 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  34.7 
 
 
651 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  31.02 
 
 
767 aa  266  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  28.01 
 
 
640 aa  151  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  25.06 
 
 
425 aa  77  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  22.15 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  22.2 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  23.08 
 
 
563 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
654 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  23.04 
 
 
391 aa  67  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  26.85 
 
 
390 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  22.47 
 
 
394 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  23.33 
 
 
469 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.13 
 
 
725 aa  57.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  26.71 
 
 
351 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  22.6 
 
 
519 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  26.45 
 
 
516 aa  54.3  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  40.4 
 
 
625 aa  53.9  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  24.07 
 
 
864 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 
537 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  25.51 
 
 
556 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
804 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
931 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  26.75 
 
 
374 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  21.2 
 
 
408 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
362 aa  49.3  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  26.09 
 
 
601 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  23.23 
 
 
536 aa  48.5  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.46 
 
 
340 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  24.56 
 
 
353 aa  47.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.62 
 
 
220 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 
222 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.36 
 
 
254 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.02 
 
 
622 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
744 aa  47.8  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
776 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 
750 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
318 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  22.77 
 
 
386 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
686 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
685 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.88 
 
 
589 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  23.77 
 
 
222 aa  45.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  23.11 
 
 
1077 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
884 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
1450 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 
250 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  30.56 
 
 
595 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
860 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.49 
 
 
1056 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  28.3 
 
 
299 aa  45.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
222 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
222 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
3145 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  24.37 
 
 
269 aa  45.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.88 
 
 
589 aa  45.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
878 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
1022 aa  45.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.31 
 
 
676 aa  44.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
974 aa  44.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
748 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 
257 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
313 aa  44.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3476  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
634 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  0.161614 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
762 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  22.42 
 
 
697 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
472 aa  44.3  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.02 
 
 
587 aa  43.9  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>