150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3904 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 755 aa  1518    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 764 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  39.54 
 
 		 781 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  37.65 
 
 		 784 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  36.1 
 
 		 773 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  34.9 
 
 		 817 aa  429  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 771 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 828 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  32.47 
 
 		 743 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  37.75 
 
 		 742 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  30.78 
 
 		 799 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  32.74 
 
 		 708 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  42.15 
 
 		 687 aa  364  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 764 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  29.92 
 
 		 778 aa  362  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  35.39 
 
 		 758 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 729 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  37.7 
 
 		 649 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 		 802 aa  335  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  29.8 
 
 		 651 aa  330  6e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  29.25 
 
 		 767 aa  244  3e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  38.11 
 
 		 399 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  37.46 
 
 		 351 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 351 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 351 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  37.79 
 
 		 399 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  35.92 
 
 		 389 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 364 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  26.73 
 
 		 640 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 654 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  23.53 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  24.5 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  23.1 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  24.04 
 
 		 394 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  22.58 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  22.84 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  23.54 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.27 
 
 		 725 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.29 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 968 aa  59.7  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 626 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.21 
 
 		 745 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 274 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 436 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 		 810 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 566 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 596 aa  55.1  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.56 
 
 		 622 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  21.72 
 
 		 563 aa  55.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 274 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 744 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.51 
 
 		 689 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 681 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.64 
 
 		 274 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 200 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.64 
 
 		 274 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 878 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  29.61 
 
 		 933 aa  52.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 		 632 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  39.18 
 
 		 233 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 466 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0939  hypothetical protein  28.89 
 
 		 287 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  31.16 
 
 		 673 aa  52  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  26.13 
 
 		 345 aa  51.6  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  30.88 
 
 		 321 aa  51.6  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 804 aa  51.6  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  37.11 
 
 		 162 aa  51.2  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 520 aa  50.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 1252 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 1252 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 685 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 750 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.06 
 
 		 733 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  21.69 
 
 		 595 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 326 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 522 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 827 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 847 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  25.44 
 
 		 697 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 		 557 aa  48.9  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 537 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  23 
 
 		 681 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 291 aa  48.9  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  35.53 
 
 		 1126 aa  48.5  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  24.52 
 
 		 353 aa  48.5  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 974 aa  48.5  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 3145 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.23 
 
 		 676 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 522 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  24.41 
 
 		 469 aa  48.5  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  22.59 
 
 		 539 aa  48.5  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25 
 
 		 764 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  29.2 
 
 		 603 aa  47.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4234  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  22.62 
 
 		 434 aa  47.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0516  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  47.4  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.643941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3476  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 		 634 aa  47.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  0.161614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  22.32 
 
 		 453 aa  47.4  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 416 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1406 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>