202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2654 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  60.73 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  61.35 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  57.95 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  58.52 
 
 		 399 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  61.08 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  62.27 
 
 		 389 aa  361  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  37.46 
 
 		 755 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.14 
 
 		 784 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 781 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 		 799 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  28.63 
 
 		 817 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  25.75 
 
 		 743 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 828 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 764 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 767 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 802 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  29.74 
 
 		 603 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.74 
 
 		 553 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.26 
 
 		 557 aa  60.1  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 624 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  27.54 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 968 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  31.1 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.39 
 
 		 810 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 		 2240 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 808 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.74 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 605 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 632 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 586 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 878 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  22.27 
 
 		 587 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 515 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 786 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  24.91 
 
 		 773 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 		 639 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 754 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 448 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 607 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 754 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 955 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.59 
 
 		 818 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 879 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.03 
 
 		 565 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 		 1486 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  22.3 
 
 		 661 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 771 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.48 
 
 		 762 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  28.48 
 
 		 762 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 607 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 607 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.78 
 
 		 632 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 873 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 643 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  30 
 
 		 604 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.6 
 
 		 274 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 2262 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.47 
 
 		 837 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.63 
 
 		 988 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.32 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  24.73 
 
 		 690 aa  50.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.6 
 
 		 274 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 313 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 3301 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.05 
 
 		 681 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 626 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 784 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1445 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 974 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  28.8 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 573 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 715 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  27.44 
 
 		 590 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 594 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.44 
 
 		 865 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.63 
 
 		 1056 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 2262 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.63 
 
 		 884 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 827 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 607 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 		 1067 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  27.54 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.54 
 
 		 631 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0733  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.08 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 		 689 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  20.94 
 
 		 1297 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 681 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 3172 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 828 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>