57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1803 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  829    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  68.78 
 
 		 390 aa  577  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  67.87 
 
 		 391 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  27.75 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  24.07 
 
 		 453 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  24.48 
 
 		 649 aa  92.8  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  23.95 
 
 		 640 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.45 
 
 		 799 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  23.14 
 
 		 773 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  28.05 
 
 		 595 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  24.28 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  23.06 
 
 		 758 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  23.91 
 
 		 651 aa  79.3  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 764 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 687 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.46 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 771 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 828 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  24.04 
 
 		 755 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  21.45 
 
 		 743 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  25.28 
 
 		 697 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  23.35 
 
 		 817 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 764 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  21.78 
 
 		 742 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  25.86 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 654 aa  63.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  24.31 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  26.15 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 802 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  21.15 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  24.6 
 
 		 516 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 537 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 353 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  41.67 
 
 		 708 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  23.91 
 
 		 656 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  26.74 
 
 		 536 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  23.32 
 
 		 709 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  23.32 
 
 		 709 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  29.91 
 
 		 561 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  21.55 
 
 		 767 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  22.49 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  23.59 
 
 		 539 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  24.15 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  22.87 
 
 		 709 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  22.87 
 
 		 709 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  22.61 
 
 		 664 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  24.04 
 
 		 645 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  23.36 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  22.42 
 
 		 709 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  21.9 
 
 		 314 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  20.74 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  22.22 
 
 		 678 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  22.77 
 
 		 687 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  22.43 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  26.71 
 
 		 236 aa  43.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>