139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1988 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  60.51 
 
 		 771 aa  932    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 764 aa  1572    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 		 784 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  41.93 
 
 		 742 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  38.06 
 
 		 817 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 		 828 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  45.4 
 
 		 687 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 781 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  38.3 
 
 		 773 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  34.79 
 
 		 743 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  39.76 
 
 		 755 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  37.95 
 
 		 758 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 764 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 		 802 aa  436  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  34.98 
 
 		 778 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  40.3 
 
 		 649 aa  428  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 729 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  36.2 
 
 		 708 aa  415  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  35.72 
 
 		 651 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  31.83 
 
 		 799 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  31.14 
 
 		 767 aa  261  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  25.63 
 
 		 640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  22.33 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  23.68 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  23.85 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  22.08 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  22.87 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  30.15 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  24.73 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 654 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  22.78 
 
 		 595 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.06 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 3301 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 3172 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 879 aa  59.3  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.93 
 
 		 1979 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.51 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  33.86 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.71 
 
 		 795 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.22 
 
 		 545 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 362 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 612 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 3145 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 681 aa  54.3  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  22.03 
 
 		 556 aa  54.3  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  23.5 
 
 		 563 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  22.28 
 
 		 386 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 827 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 792 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 909 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 502 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  22.22 
 
 		 539 aa  52.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  26.96 
 
 		 386 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 537 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 318 aa  51.6  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  26.78 
 
 		 577 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.64 
 
 		 732 aa  50.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 686 aa  50.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 714 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 		 293 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  28.47 
 
 		 389 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0419  hypothetical protein  31.62 
 
 		 122 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.831767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 643 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 		 864 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 767 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1714 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.82 
 
 		 837 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 715 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.57 
 
 		 340 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.57 
 
 		 624 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.79 
 
 		 589 aa  48.9  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 416 aa  48.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 878 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 217 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.62 
 
 		 810 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  22.69 
 
 		 697 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 596 aa  48.1  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 673 aa  48.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0327  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 413 aa  48.1  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.57 
 
 		 816 aa  48.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 804 aa  47.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.77 
 
 		 603 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 637 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 494 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.14 
 
 		 875 aa  47.8  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 602 aa  47.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  31.07 
 
 		 594 aa  47.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.03 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 3035 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0206  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 345 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.58 
 
 		 623 aa  47.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 766 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>