More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3410 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  51.14 
 
 		 828 aa  745    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 781 aa  1588    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  50 
 
 		 773 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  51.61 
 
 		 784 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  48.58 
 
 		 817 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  43.03 
 
 		 742 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  37.89 
 
 		 743 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  40.68 
 
 		 708 aa  498  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 764 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 771 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 778 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  38.93 
 
 		 758 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  39.54 
 
 		 755 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 764 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  33.15 
 
 		 799 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  35.49 
 
 		 651 aa  429  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 729 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 802 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  40.7 
 
 		 687 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  36.49 
 
 		 649 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  29.65 
 
 		 767 aa  251  4e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  28.19 
 
 		 640 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2940  hypothetical protein  69.05 
 
 		 83 aa  107  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  25.58 
 
 		 425 aa  99  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  29.34 
 
 		 351 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 399 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  24.52 
 
 		 390 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  30.57 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  31.42 
 
 		 345 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 351 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 776 aa  75.5  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.69 
 
 		 810 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 909 aa  71.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 		 654 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.69 
 
 		 725 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 681 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.84 
 
 		 780 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 3145 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.84 
 
 		 2240 aa  68.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 847 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  23.81 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 739 aa  67.8  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  24.15 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 362 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 632 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 878 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 620 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.01 
 
 		 816 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  20.47 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.72 
 
 		 865 aa  65.1  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.56 
 
 		 622 aa  65.1  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 3035 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 968 aa  63.9  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 689 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 750 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 362 aa  63.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 636 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.58 
 
 		 603 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  38.89 
 
 		 703 aa  62  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 3172 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 974 aa  61.6  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 3301 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.53 
 
 		 676 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 3560 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 714 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 615 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27 
 
 		 565 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  22.86 
 
 		 556 aa  60.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1276 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 		 790 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  35.29 
 
 		 1154 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  30.91 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  34.71 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 744 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 2262 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 2262 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>