More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0602 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  100 
 
 
817 aa  1682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  72.01 
 
 
773 aa  1111    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  59.1 
 
 
784 aa  948    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  48.58 
 
 
781 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  62.12 
 
 
828 aa  972    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  38.08 
 
 
743 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  43.42 
 
 
742 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 
764 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 
771 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  34.78 
 
 
778 aa  475  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 
764 aa  442  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  36.87 
 
 
708 aa  439  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 
802 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  34.9 
 
 
755 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  36.09 
 
 
651 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  34.84 
 
 
758 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
729 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  30.17 
 
 
799 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 
687 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  35.14 
 
 
649 aa  364  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  30.23 
 
 
767 aa  254  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  27.64 
 
 
640 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  27.11 
 
 
425 aa  111  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.48 
 
 
810 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  28.63 
 
 
351 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.46 
 
 
587 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
878 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 
632 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.97 
 
 
340 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
847 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
685 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  23.35 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  27.52 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  23.22 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.96 
 
 
884 aa  67.8  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
265 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  24.79 
 
 
390 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
364 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
681 aa  66.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  25.35 
 
 
391 aa  65.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  22.04 
 
 
408 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
248 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 
776 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.94 
 
 
795 aa  65.1  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  21.89 
 
 
556 aa  65.1  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
573 aa  64.7  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.03 
 
 
622 aa  64.3  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.54 
 
 
603 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
323 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
612 aa  63.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.75 
 
 
565 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
362 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
351 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.79 
 
 
545 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
968 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  34.71 
 
 
437 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
505 aa  63.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
362 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.8 
 
 
816 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.22 
 
 
620 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.21 
 
 
764 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.92 
 
 
359 aa  62.4  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.89 
 
 
725 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  36.52 
 
 
566 aa  61.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  26.19 
 
 
345 aa  61.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  28.83 
 
 
299 aa  61.2  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.51 
 
 
433 aa  61.2  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
827 aa  60.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
639 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.11 
 
 
626 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
739 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
909 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.11 
 
 
626 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
620 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
718 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.08 
 
 
820 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 
637 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.21 
 
 
875 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  32.57 
 
 
1013 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
583 aa  58.9  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 
572 aa  58.9  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
567 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
329 aa  58.5  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  28.15 
 
 
955 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.82 
 
 
623 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
399 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.38 
 
 
266 aa  58.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.65 
 
 
1138 aa  57.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
636 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
243 aa  57.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
615 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
494 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>