47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003597 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  100 
 
 		 345 aa  701    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  31.06 
 
 		 708 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  28.34 
 
 		 778 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 781 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 828 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  26.19 
 
 		 817 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.41 
 
 		 799 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 1073 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 		 399 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.43 
 
 		 784 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  26.13 
 
 		 755 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2504  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 678 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.195279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 802 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1276 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 729 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  24.91 
 
 		 773 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.66 
 
 		 565 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  26.7 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  26.2 
 
 		 758 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 754 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.94 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 1459 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 152 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 1056 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2910  hypothetical protein  27.78 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  26.36 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 927 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  25.22 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 883 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.27 
 
 		 746 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.06 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 448 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 247 aa  42.7  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  28.71 
 
 		 638 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  24.75 
 
 		 651 aa  42.7  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>