63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0783 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  100 
 
 		 651 aa  1373    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 781 aa  429  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  35.83 
 
 		 784 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  36.09 
 
 		 817 aa  419  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 828 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  36.52 
 
 		 773 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  35.72 
 
 		 764 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  34.49 
 
 		 764 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 771 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  33.97 
 
 		 708 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 802 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  35.27 
 
 		 758 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  34.93 
 
 		 742 aa  365  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  32.8 
 
 		 778 aa  363  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  32.27 
 
 		 743 aa  354  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 687 aa  335  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  32.78 
 
 		 649 aa  327  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  30.47 
 
 		 755 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 729 aa  323  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  29.44 
 
 		 799 aa  296  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  28.02 
 
 		 767 aa  238  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  26.81 
 
 		 640 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  24.94 
 
 		 425 aa  94  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  25.35 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  23.91 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 654 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  23.47 
 
 		 390 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  22.25 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  22.28 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  24.34 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  22.94 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  24.02 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  23.08 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  21.22 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  24.35 
 
 		 697 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 277 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  26.43 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  22.61 
 
 		 656 aa  47.8  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 351 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  26.38 
 
 		 363 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  22.25 
 
 		 664 aa  46.6  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  22.44 
 
 		 519 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 193 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 364 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  24.58 
 
 		 353 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 629 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  20.77 
 
 		 676 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  27.56 
 
 		 812 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1601 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  22.04 
 
 		 645 aa  44.7  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  21.98 
 
 		 709 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  31.43 
 
 		 174 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  26.14 
 
 		 307 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  42.25 
 
 		 646 aa  44.3  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1343 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  23.34 
 
 		 709 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 377 aa  43.9  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 624 aa  43.9  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.38 
 
 		 884 aa  43.9  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  19.9 
 
 		 539 aa  43.9  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>