62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3498 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  825    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  67.87 
 
 		 394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  64.36 
 
 		 390 aa  544  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  28.3 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  24.94 
 
 		 640 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  23.7 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  24.93 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  25.35 
 
 		 651 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  25.28 
 
 		 773 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 687 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 771 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.56 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  25.07 
 
 		 778 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  28.33 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 828 aa  73.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  22.97 
 
 		 758 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 764 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.72 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  30.81 
 
 		 595 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 781 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  23.4 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 654 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  23.04 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  25.35 
 
 		 817 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 764 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  22.59 
 
 		 755 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  24.12 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  22.9 
 
 		 743 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 729 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  26.48 
 
 		 708 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  23.08 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  24.88 
 
 		 697 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 802 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  22.66 
 
 		 767 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  26.71 
 
 		 656 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  23.94 
 
 		 316 aa  53.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  27.62 
 
 		 469 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  24.47 
 
 		 519 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  24.79 
 
 		 316 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  24.27 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  22.37 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  21.79 
 
 		 516 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  21.46 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  23.51 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  26.78 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  19.79 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  25.82 
 
 		 539 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  25.24 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  22.67 
 
 		 236 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  25.37 
 
 		 312 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  24.51 
 
 		 314 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  24.51 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  26.15 
 
 		 645 aa  46.2  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  24.76 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  23.87 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  24.88 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  27.1 
 
 		 561 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  23.78 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  29.07 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4234  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  24.19 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  23.2 
 
 		 536 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>