257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003600 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  46.67 
 
 		 778 aa  699    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  100 
 
 		 708 aa  1498    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 		 781 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  37.5 
 
 		 784 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 828 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  38.05 
 
 		 743 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  37.72 
 
 		 773 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  36.87 
 
 		 817 aa  439  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  37.44 
 
 		 742 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 764 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 729 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 771 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  33.04 
 
 		 799 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  33.97 
 
 		 651 aa  373  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  32.39 
 
 		 755 aa  360  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  31.3 
 
 		 758 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  34.55 
 
 		 649 aa  346  7e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 802 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 764 aa  335  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 687 aa  311  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  27.64 
 
 		 767 aa  218  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  31.06 
 
 		 345 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  25.64 
 
 		 640 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  24.16 
 
 		 453 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  25.14 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.42 
 
 		 810 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  24.51 
 
 		 390 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.88 
 
 		 2240 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  25 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 878 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 1061 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 654 aa  62  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  26.48 
 
 		 391 aa  62  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 374 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  24.09 
 
 		 563 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 847 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  27.54 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.77 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 3145 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  34.88 
 
 		 955 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  28.74 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.63 
 
 		 577 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 		 632 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 615 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.76 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.63 
 
 		 577 aa  55.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 1737 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 639 aa  55.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  24.31 
 
 		 556 aa  54.7  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 448 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.8 
 
 		 620 aa  54.3  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 827 aa  54.3  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 620 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 685 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  27.87 
 
 		 682 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 		 399 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.77 
 
 		 622 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 537 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 612 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.36 
 
 		 818 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 		 784 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 637 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 611 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2282  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 354 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.989795  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 635 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.89 
 
 		 1022 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  29.01 
 
 		 695 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 636 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 635 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  41.67 
 
 		 394 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.33 
 
 		 340 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.84 
 
 		 820 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  27.66 
 
 		 202 aa  51.2  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 654 aa  51.2  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 486 aa  51.2  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 542 aa  51.2  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  33.01 
 
 		 734 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.93 
 
 		 733 aa  51.2  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1192 aa  50.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 301 aa  50.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 		 1252 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 465 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 219 aa  50.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  29.66 
 
 		 208 aa  50.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.23 
 
 		 661 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  29.25 
 
 		 437 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 318 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.98 
 
 		 764 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 222 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  24.41 
 
 		 219 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 362 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 		 689 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.83 
 
 		 875 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.4 
 
 		 1067 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>