214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2987 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 778 aa  1639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  46.67 
 
 		 708 aa  699    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  36.33 
 
 		 743 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 828 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  35.16 
 
 		 773 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  36.51 
 
 		 784 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  34.78 
 
 		 817 aa  475  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 781 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  34.76 
 
 		 742 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 764 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  34.45 
 
 		 799 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 771 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 764 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  32.8 
 
 		 651 aa  363  6e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  30.99 
 
 		 649 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 802 aa  356  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  31.9 
 
 		 758 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  29.92 
 
 		 755 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 687 aa  302  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  28.73 
 
 		 767 aa  235  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  28.34 
 
 		 345 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  22.5 
 
 		 640 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  23.53 
 
 		 425 aa  88.6  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  24.28 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  22.57 
 
 		 390 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  25.07 
 
 		 391 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  22.87 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 		 654 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  22.17 
 
 		 403 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 878 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  20.29 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  23.9 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  21.6 
 
 		 539 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1421 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 249 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 249 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 		 237 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.51 
 
 		 632 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 		 264 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 649 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.88 
 
 		 818 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 363 aa  54.7  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 750 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  23.85 
 
 		 563 aa  54.7  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 216 aa  54.7  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 968 aa  54.3  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26 
 
 		 267 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 406 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 406 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 3145 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  23.55 
 
 		 697 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 789 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  19.64 
 
 		 4079 aa  53.9  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  28.18 
 
 		 585 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.38 
 
 		 370 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 		 784 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  30.22 
 
 		 174 aa  52.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  30.83 
 
 		 208 aa  52.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  23.2 
 
 		 469 aa  52.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  22.92 
 
 		 1252 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  52.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  25.22 
 
 		 329 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28 
 
 		 340 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  25.9 
 
 		 656 aa  51.6  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 209 aa  51.6  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 		 370 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 		 399 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 890 aa  51.2  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  26.09 
 
 		 333 aa  51.2  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.93 
 
 		 250 aa  51.2  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  23.49 
 
 		 519 aa  51.2  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.56 
 
 		 1022 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.91 
 
 		 1056 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 3035 aa  51.2  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 565 aa  50.8  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.92 
 
 		 1252 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  29.69 
 
 		 219 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 208 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 1737 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 280 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 250 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 301 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 351 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.37 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 586 aa  50.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 955 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.74 
 
 		 988 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  25.22 
 
 		 333 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 293 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  20.89 
 
 		 556 aa  49.3  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.63 
 
 		 820 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  23.45 
 
 		 269 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>