21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3248 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  100 
 
 
697 aa  1434    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  26.11 
 
 
425 aa  93.2  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  26.44 
 
 
595 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  25.68 
 
 
563 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  25.28 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  25.18 
 
 
390 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  24.15 
 
 
556 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  22.63 
 
 
743 aa  60.1  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  23.69 
 
 
391 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  21.23 
 
 
403 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  24.35 
 
 
651 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  23.55 
 
 
778 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  24.03 
 
 
640 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  24.52 
 
 
649 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  25.44 
 
 
755 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  23.58 
 
 
817 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.06 
 
 
799 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 
764 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  22.52 
 
 
773 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  31.82 
 
 
561 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3316  hypothetical protein  41.27 
 
 
177 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>