210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2378 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 743 aa  1564    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  38.48 
 
 		 784 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 		 828 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  38.08 
 
 		 817 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  37.9 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  38.49 
 
 		 742 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 781 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  36.33 
 
 		 778 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  34.66 
 
 		 799 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  38.05 
 
 		 708 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 771 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  34.79 
 
 		 764 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 729 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  34.34 
 
 		 758 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  32.47 
 
 		 755 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 802 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 764 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  35.86 
 
 		 649 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 687 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  32.27 
 
 		 651 aa  354  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  26.96 
 
 		 767 aa  250  5e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  25 
 
 		 640 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  22.97 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  22.44 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  25.75 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  21.45 
 
 		 394 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 351 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  22.9 
 
 		 391 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  22.28 
 
 		 390 aa  62  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  30.89 
 
 		 734 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  21.01 
 
 		 408 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  24.36 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 718 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  22.4 
 
 		 386 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.02 
 
 		 556 aa  60.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  22.63 
 
 		 697 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  23.84 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1676 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 3145 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.49 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.27 
 
 		 865 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  27.49 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  23.64 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.6 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 226 aa  57.4  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 1737 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  23.55 
 
 		 399 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 968 aa  55.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.43 
 
 		 603 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 448 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 878 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25 
 
 		 733 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.38 
 
 		 622 aa  54.7  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 808 aa  54.3  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 274 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 605 aa  54.3  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 612 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 750 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 636 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25 
 
 		 764 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 274 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 639 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  25.7 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 		 632 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 792 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 715 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 274 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 739 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 611 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 635 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 1252 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1106 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 635 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 1061 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 542 aa  52  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 313 aa  52  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 274 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 394 aa  51.2  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 615 aa  51.2  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 637 aa  50.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 		 1252 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 643 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  23.67 
 
 		 353 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 639 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 		 364 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 291 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 597 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 637 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 362 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.6 
 
 		 289 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  25.68 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 209 aa  49.7  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.1 
 
 		 1022 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 		 383 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 620 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 646 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>