More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1945 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  57.97 
 
 		 817 aa  975    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  64.91 
 
 		 773 aa  980    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  63.66 
 
 		 784 aa  984    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 828 aa  1713    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  51.14 
 
 		 781 aa  744    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  44.8 
 
 		 742 aa  582  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  37.62 
 
 		 743 aa  532  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 771 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 		 764 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  34.52 
 
 		 778 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  37.04 
 
 		 708 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  38.16 
 
 		 758 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 802 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  35.01 
 
 		 764 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  35.26 
 
 		 755 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 		 729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  34.38 
 
 		 651 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  32.31 
 
 		 799 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 687 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  34.98 
 
 		 649 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  28.07 
 
 		 767 aa  256  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  26.2 
 
 		 640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  27.49 
 
 		 425 aa  101  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  28.06 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  23.44 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  24.34 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 685 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 968 aa  73.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  26.17 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  28.09 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  26.6 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  38.85 
 
 		 703 aa  70.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.91 
 
 		 865 aa  67.8  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.85 
 
 		 603 aa  67.8  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  22.22 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.12 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 639 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 1737 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  33.96 
 
 		 937 aa  65.1  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  32.5 
 
 		 437 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 637 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.64 
 
 		 1677 aa  62.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 1094 aa  62.4  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 878 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1276 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 3035 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.62 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  31.36 
 
 		 566 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 711 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.85 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.6 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  21.91 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 750 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 909 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 864 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 4489 aa  58.9  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 847 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  31.41 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.69 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  21.34 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.72 
 
 		 820 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 637 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 542 aa  57  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 329 aa  57.4  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 362 aa  57.4  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 505 aa  57  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 265 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.32 
 
 		 795 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  30.51 
 
 		 430 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 374 aa  56.6  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 3560 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  31.47 
 
 		 545 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 573 aa  56.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 739 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 715 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 620 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.8 
 
 		 620 aa  55.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.61 
 
 		 622 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  25.7 
 
 		 682 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  34.65 
 
 		 529 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 		 955 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.52 
 
 		 887 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>