234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1166 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  100 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  73.52 
 
 		 216 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  75.45 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  43.79 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  38.76 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  54.4 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  48.51 
 
 		 283 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  48.51 
 
 		 283 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  48.51 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  48.51 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  48.51 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  48.51 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  48.51 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  48.51 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.06 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  49.62 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  49.62 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  49.62 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  49.62 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  49.62 
 
 		 251 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  48.85 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  46.45 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  43.8 
 
 		 188 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  51.26 
 
 		 190 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  44.93 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  44.64 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  41.4 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 387 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  42.34 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  46.34 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  37.09 
 
 		 393 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  44.29 
 
 		 178 aa  101  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  40.6 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  40.48 
 
 		 373 aa  99  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  41.86 
 
 		 319 aa  98.2  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.68 
 
 		 302 aa  91.7  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 271 aa  84.7  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 625 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.47 
 
 		 764 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0731  hypothetical protein  36.72 
 
 		 567 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 909 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 750 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  24.81 
 
 		 725 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 739 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 685 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 3145 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 637 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 681 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 750 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.2 
 
 		 635 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.29 
 
 		 818 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 784 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 649 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1421 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.41 
 
 		 816 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 716 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 301 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 265 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  24.17 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 778 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 927 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 637 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2921  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 527 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.91 
 
 		 837 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.46 
 
 		 622 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 879 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 274 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 		 1022 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 639 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 635 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  31.65 
 
 		 385 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 635 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 878 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 4489 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 306 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 611 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 		 645 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 1486 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.73 
 
 		 746 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1676 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 543 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 612 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.77 
 
 		 810 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 1385 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 636 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.78 
 
 		 865 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 761 aa  48.5  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 766 aa  48.5  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 578 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>