242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1882 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  760    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  41.94 
 
 		 345 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  62.58 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  54.14 
 
 		 215 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  58.49 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  56.89 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  61.22 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  53.57 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  47.7 
 
 		 196 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  55.92 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  55.24 
 
 		 188 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  52.32 
 
 		 190 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  52.05 
 
 		 219 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  52.03 
 
 		 190 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  48.97 
 
 		 178 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  43.06 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  40.48 
 
 		 218 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.13 
 
 		 254 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 221 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 251 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 251 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 221 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  43.08 
 
 		 283 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  43.08 
 
 		 283 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  43.65 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  43.65 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  43.08 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  43.08 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  43.08 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 240 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  41.73 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 625 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 216 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  41.59 
 
 		 216 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  38.84 
 
 		 251 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  40.8 
 
 		 271 aa  96.3  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.67 
 
 		 636 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 216 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  41.28 
 
 		 219 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.83 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  31.13 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 878 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.69 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.84 
 
 		 810 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.15 
 
 		 875 aa  62.8  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1753  hypothetical protein  29.69 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.38 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 649 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  30.97 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.85 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 3145 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 1022 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 3172 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 592 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 612 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.55 
 
 		 837 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 637 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33 
 
 		 820 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 636 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.36 
 
 		 626 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 762 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 4079 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  32.76 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 646 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  29.66 
 
 		 538 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  35.05 
 
 		 222 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 828 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1406 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  29.92 
 
 		 514 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.21 
 
 		 642 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 828 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 688 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  27.4 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 833 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 649 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 649 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.86 
 
 		 708 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 280 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 1486 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 750 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 638 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.2 
 
 		 746 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>